全基因組測序
2018-04-11
腫瘤樣本全基因組測序(推薦50乘深度)
腫瘤樣本全基因組測序(推薦50乘深度)
文(wén)庫類型: ~ 350bp 插入片段
測序策略: Illumina PE150 測序
測序深度: 150G raw data
1. 數據質控:去(qù)除接頭污染和(hé)低(dī)質量數據
2. 與參考序列進行比對(duì)、統計(jì)測序深度及覆蓋度
3. Somatic SNV/InDel/SV/CNV 檢測、注釋及統計(jì)(成對(duì)樣本)
A+ 分析
基本信息分析 基礎上(shàng)增加 5 項分析:
1. 易感基因篩查
2. 高(gāo)頻(pín)突變基因統計(jì)及通(tōng)路(lù)富集分析
3. NMF 突變特征及突變頻(pín)譜分析
4. NovoDriver 已知驅動基因篩選
5. 基因組變異 Circos 圖展示
啓動子(zǐ)活性檢測
下(xià)載1:啓動子(zǐ)活性檢測介紹
下(xià)載2:啓動子(zǐ)活性檢測合同模闆